小编给大家分享一下Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包,相信大部分人都还不怎么了解,因此分享这篇文章给大家参考一下,希望大家阅读完这篇文章后大有收获,下面让我们一起去了解一下吧!
1. 预先准备
Windows下需要安装Rtools,R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp
,自定义头文件test_h.h
。
源文件示例func.cpp
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]#include <RcppArmadillo.h>#include <vector>#include "./test_h.h"using namespace Rcpp;using namespace std;// using namespace arma;// [[Rcpp::export]]RObject func(){ arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu); std::cout<<CONDIT<<std::endl; return wrap(A);}
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
:用于指明需要使用RcppArmadillo。
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
:指明需要使用C++11。
#include "./test_h.h"
:表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""
包括起来,并加上.h
。./
表示在当下文件夹(src)下搜寻文件。
// using namespace arma;
不一定有用。如果要用Armadillo的数据结构,在其之前需指明arma::
。
func()
函数将可以直接在R中调用。
头文件示例test_h.h
#include <iostream>#define CONDIT 1000
2. 创建R包步骤
新建R Package
选择Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手动复制到src文件夹下。
R包的文件结构
修改DESCRIPTION文件
将RcppArmadillo添加进Imports和LinkingTo中。
Package: RcppPackTestType: PackageTitle: What the Package Does (Title Case)Version: 0.1.0Author: Who wrote itMaintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>Description: More about what it does (maybe more than one line) Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.License: What license is it under?Encoding: UTF-8LazyData: trueImports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadilloLinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo
Build & Reload 建立包
3. C++11标准问题
如果要使用C++11标准,第一种方法是在Makevars文件中添加如下代码:
CXX = g++-4.8.1PKG_CXXFLAGS = -std=c++11
第二种方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
以上是“Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注编程网行业资讯频道!