和弦图 (Chord Diagram)
和弦图创造性地展示了数据点之间复杂的关系。节点围绕一个圆圈排列，通过弧线连接。弧线的长度反映了连接值，其粗细表示关系的重要性。颜色对数据进行分类，使比较变得容易。广泛应用于各个领域，特别是在可视化遗传数据方面。
以下是一个使用 Holoviews & Bokeh 创建显示五个国家之间贸易关系的和弦图的示例。
import holoviews as hv
from holoviews import opts
import pandas as pd
import numpy as np
hv.extension('bokeh')
# Sample matrix representing the export volumes between 5 countries
export_data = np.array([[0, 50, 30, 20, 10],
[10, 0, 40, 30, 20],
[20, 10, 0, 35, 25],
[30, 20, 10, 0, 40],
[25, 15, 30, 20, 0]])
labels = ['USA', 'China', 'Germany', 'Japan', 'India']
# Creating a pandas DataFrame
df = pd.DataFrame(export_data, index=labels, columns=labels)
df = df.stack().reset_index()
df.columns = ['source', 'target', 'value']
# Creating a Chord object
chord = hv.Chord(df)
# Styling the Chord diagram
chord.opts(
opts.Chord(
cmap='Category20', edge_cmap='Category20',
labels='source', label_text_font_size='10pt',
edge_color='source', node_color='index',
width=700, height=700
)
).select(value=(5, None))
# Display the plot
chord参考链接：
- https://holoviews.org/reference/elements/matplotlib/Chord.html
- https://github.com/moshi4/pyCirclize
Sunburst Chart
Sunburst Chart 通过清晰展示层次数据，超越了传统的饼图和环图。它使用同心圆，每个圆代表层次中的一级。中心是根，扇形表示节点。每个扇形的大小反映了它的值，直观地理解数据的重要性。在可视化文件系统层次结构、用户导航路径、市场细分和遗传数据方面非常有用。以下是一个使用 Plotly 库创建Sunburst Chart 的示例。
import plotly.express as px
import numpy as np
df = px.data.gapminder().query("year == 2007")
fig = px.sunburst(df, path=['continent', 'country'],
values='pop',
color='lifeExp',
hover_data=['iso_alpha'],
color_continuous_scale='RdBu',
color_continuous_midpoint=np.average(df['lifeExp'], weights=df['pop']))
fig.show()参考链接：https://plotly.com/python/sunburst-charts/
六边形分箱图 (Hexbin Plot)
六边形分箱图，或称六边形分箱，对于可视化二维数据分布非常有效，特别是当数据点密集时。它将数据空间划分为六边形箱，颜色表示每个箱中的点数，清晰地表示数据分布。
以下是一个使用 Python 和 Matplotlib 创建六边形分箱图的示例，展示了空气质量指数 (AQI) 与医院访问之间的相关性。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mplhexbin import HexBin
# Simulated data
np.random.seed(0) # Ensure reproducibility
n_points = 10000
x = np.random.rand(n_points) * 100 # Air Quality Index (AQI) range from 0 to 100
y = 5 * np.sin(x * np.pi / 50) + np.random.randn(n_points) * 15 # Simulated hospital visits, related to AQI but with noise
# Create a new figure
fig, ax = plt.subplots(figsize=(10, 8))
# Use HexBin to create a hexagonal bin plot
hb = HexBin(ax, gridsize=20, cmap='viridis', extent=[0, 100, -30, 50]) # Set grid size, colormap, and range
hb.hexbin(x, y, mincnt=1) # Draw the hexagonal bin plot, mincnt sets the minimum count threshold
# Add title and axis labels
ax.set_title('Relationship between Air Quality Index (AQI) and Hospital Visits')
ax.set_xlabel('Air Quality Index (AQI)')
ax.set_ylabel('Hospital Visits')
# Show the figure
plt.colorbar(hb.cmap, ax=ax, label='Number of Data Points') # Add color bar and set label
plt.show()参考链接：https://matplotlib.org/stable/gallery/statistics/hexbin_demo.html
桑基图 (Sankey Diagram)
桑基图可视化数据流，非常适合能源、材料和财务数据。以 Matthew Henry Phineas Riall Sankey 命名，它显示了系统各阶段或部分之间的流量。节点宽度与流量数量成比例，易于理解数据规模和方向。
以下是一个使用 Python 创建桑基图的示例，展示了从生产源头到小城市消费者的能量流。
import plotly.graph_objects as go
labels = ["Coal", "Solar", "Wind", "Nuclear", "Residential", "Industrial", "Commercial"]
source = [0, 1, 2, 3, 0, 1, 2, 3]
target = [4, 4, 4, 4, 5, 5, 5, 5]
value = [25, 10, 40, 20, 30, 15, 25, 35]
# Create the Sankey diagram object
fig = go.Figure(data=[go.Sankey(
node=dict(
pad=15,
thickness=20,
line=dict(color="black", width=0.5),
label=labels
),
link=dict(
source=source,
target=target,
value=value
))])
fig.update_layout(title_text="Energy Flow in Model City", font_size=12)
fig.show()参考链接：https://plotly.com/python/sankey-diagram/
流图 (Stream Graph, 主题河流)
流图类似于河流，描绘了随时间的变化。颜色区分类别，而“河流”的宽度表示每个类别的值。它直观地展示趋势和关系，易于理解数据动态。
以下是一个使用 Altair 库创建流图的示例。
import altair as alt
from vega_datasets import data
source = data.unemployment_across_industries.url
alt.Chart(source).mark_area().encode(
alt.X('yearmonth(date):T',
axis=alt.Axis(format='%Y', domain=False, tickSize=0)
),
alt.Y('sum(count):Q', stack='center', axis=None),
alt.Color('series:N',
scale=alt.Scale(scheme='category20b')
)
).interactive()参考链接：https://altair-viz.github.io/gallery/streamgraph.html
