Python 和 C++ 混合编程:pybind11 使用
1. 目的需求
我们通常在 Python 上进行算法开发,因为 Python 编程方便,易于快速验证算法。而在验证算法正确后,如果对运行效率有更高要求的话,则会将计算密集的模块使用 C/C++ 重新实现,来达到代码运行效率加速的效果。所以,这就涉及到了 Python 和 C++ 混合编程,而在这方面 pybind11 是一个很流行的库,可以很好的开展 Python 和 C++ 混合编程,并通过 Python 的 import 调用动态链接库(.so/.pyd等)达到本地代码加速。
2. pybind 11 简介
pybind11 是一个轻量级的只包含头文件的库,它在Python中公开C++类型,反之亦然,主要用于创建现有C++代码的Python绑定。它的目标和语法类似于David Abrahams的优秀Boost.Python库:通过使用编译时内省推断类型信息,最大限度地减少传统扩展模块中的样板代码。
3. 使用实践:一个简单的实例
3.1 开发环境
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ubuntu 20.04
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cmake
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python 3.9:此处实践中,使用 conda 管理 python 虚拟环境,此处新建 env_test 环境,可参考 Anaconda 的使用;对于非虚拟环境,方法大同小异;
3.2 准备工作
- 安装相关库
conda install pybind11conda install pytest
- 查看库列表
(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ conda list# packages in environment at /home/hjw/anaconda3/envs/env_test:## Name Version Build Channel_libgcc_mutex 0.1 main https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main_openmp_mutex 5.1 1_gnu https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainattrs 22.1.0 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainca-certificates 2023.01.10 h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainexceptiongroup 1.0.4 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/maininiconfig 1.1.1 pyhd3eb1b0_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainld_impl_linux-64 2.38 h1181459_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainlibffi 3.3 he6710b0_2 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainlibgcc-ng 11.2.0 h1234567_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainlibgomp 11.2.0 h1234567_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainlibstdcxx-ng 11.2.0 h1234567_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainncurses 6.4 h6a678d5_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainopenssl 1.1.1t h7f8727e_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpackaging 23.0 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpip 23.0.1 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpluggy 1.0.0 py39h06a4308_1 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpybind11 2.10.4 py39hdb19cb5_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpybind11-global 2.10.4 py39hdb19cb5_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpytest 7.3.1 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainpython 3.9.0 hdb3f193_2 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainreadline 8.2 h5eee18b_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainsetuptools 67.8.0 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainsqlite 3.41.2 h5eee18b_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/maintk 8.6.12 h1ccaba5_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/maintomli 2.0.1 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/maintzdata 2023c h04d1e81_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainwheel 0.38.4 py39h06a4308_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainxz 5.4.2 h5eee18b_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/mainzlib 1.2.13 h5eee18b_0 https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$
3.3 建立工程 test
- 1、新建工程目录文件夹
mkdir test
- 2、新建 build 文件夹
cd testmkdir build
- 3、编写 CMakeLists.txt
gedit CMakeLists.txt
CMakeLists.txt
内容如下:
cmake_minimum_required(VERSION 3.1)project(test)set(PYTHON_EXECUTABLE /home/hjw/anaconda3/envs/env_test/bin/python)set(pybind11_DIR "/home/hjw/anaconda3/envs/env_test/lib/python3.9/site-packages/pybind11/share/cmake/pybind11/")find_package(pybind11 REQUIRED)# add_subdirectory(pybind11)pybind11_add_module(test test.cpp)
其中,PYTHON_EXECUTABLE 和 pybind11_DIR 需要根据对应环境,进行修改适配。
- 4、编写 test.cpp
gedit test.cpp
test.cpp
内容如下:
#include #include namespace py = pybind11;int demo(int a, int b){ int result = 0; result = a * b; std::cout << "result is " << result << std::endl; return result;}PYBIND11_MODULE(test, m){ // 可选,说明这个模块的作用 m.doc() = "pybind11 test plugin"; //def("提供给python调用的方法名", &实际操作的函数, "函数功能说明", 默认参数). 其中函数功能说明为可选 m.def("demo", &demo, "A function which multiplies two numbers", py::arg("a")=6, py::arg("b")=7);}
- 5、查看最终目录内容
(env_test) hjw@hjw-pc:~$ mkdir test(env_test) hjw@hjw-pc:~$ cd test(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ mkdir build(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ gedit CMakeLists.txt(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ gedit test.cpp(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ lltotal 20drwxrwxr-x 3 hjw hjw 4096 Jun 7 16:44 ./drwxr-xr-x 45 hjw hjw 4096 Jun 7 16:44 ../drwxrwxr-x 2 hjw hjw 4096 Jun 7 16:42 build/-rw-rw-r-- 1 hjw hjw 330 Jun 7 16:43 CMakeLists.txt-rw-rw-r-- 1 hjw hjw 449 Jun 7 16:44 test.cpp(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$
3.4 编译工程 test 库
cd buildcmake ..make -j4
(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ cd build(env_test) hjw@hjw-pc:~/test/build$ cmake ..-- The C compiler identification is GNU 9.4.0-- The CXX compiler identification is GNU 9.4.0-- Check for working C compiler: /usr/bin/cc-- Check for working C compiler: /usr/bin/cc -- works-- Detecting C compiler ABI info-- Detecting C compiler ABI info - done-- Detecting C compile features-- Detecting C compile features - done-- Check for working CXX compiler: /usr/bin/c++-- Check for working CXX compiler: /usr/bin/c++ -- works-- Detecting CXX compiler ABI info-- Detecting CXX compiler ABI info - done-- Detecting CXX compile features-- Detecting CXX compile features - done-- Found PythonInterp: /home/hjw/anaconda3/envs/env_test/bin/python (found suitable version "3.9", minimum required is "3.6") -- Found PythonLibs: /home/hjw/anaconda3/envs/env_test/lib/libpython3.9.so-- Performing Test HAS_FLTO-- Performing Test HAS_FLTO - Success-- Found pybind11: /home/hjw/anaconda3/envs/env_test/lib/python3.9/site-packages/pybind11/include (found version "2.10.4")-- Configuring done-- Generating done-- Build files have been written to: /home/hjw/test/build(env_test) hjw@hjw-pc:~/test/build$ make -j4Scanning dependencies of target test[ 50%] Building CXX object CMakeFiles/test.dir/test.cpp.o[100%] Linking CXX shared module test.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so[100%] Built target test(env_test) hjw@hjw-pc:~/test/build$
其中 test.cpython-39-x86_64-linux-gnu.so
即为最终的 test 库 文件
3.5 Python 调用 工程 test 库
- 编写 example.py
(env_test) hjw@hjw-pc:~/test/build$ cd ..(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ gedit example.py(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$
- example.py 内容如下:
import syssys.path.insert(0, '/home/hjw/test/build')import testif __name__ == "__main__": result = test.demo(3, 4) print(result )
- example.py 运行结果如下:
(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$ python3 example.py result is 1212(env_test) hjw@hjw-pc:~/test$
4. 实线小结
通过 第3节 的介绍,已经完成了一个 Python 和 C++ 混合编程的小闭环了,下面对于具体 内容,如 Numpy、Eigen 的使用也就只是细节的完善了,可以参考 第5节 参考资料详细了解。
4.1 Numpy 接口
- 1、buffer_info 的定义,py:buffer_info的内容反映了Python缓冲区协议规范
struct buffer_info { void *ptr; ssize_t itemsize; std::string format; ssize_t ndim; std::vector<ssize_t> shape; std::vector<ssize_t> strides;};
- 2、两个 Numpy 数组相加示例
#include #include namespace py = pybind11;py::array_t<double> add_arrays(py::array_t<double> input1, py::array_t<double> input2) { py::buffer_info buf1 = input1.request(), buf2 = input2.request(); if (buf1.ndim != 1 || buf2.ndim != 1) throw std::runtime_error("Number of dimensions must be one"); if (buf1.size != buf2.size) throw std::runtime_error("Input shapes must match"); auto result = py::array_t<double>(buf1.size); py::buffer_info buf3 = result.request(); double *ptr1 = static_cast<double *>(buf1.ptr); double *ptr2 = static_cast<double *>(buf2.ptr); double *ptr3 = static_cast<double *>(buf3.ptr); for (size_t idx = 0; idx < buf1.shape[0]; idx++) ptr3[idx] = ptr1[idx] + ptr2[idx]; return result;}PYBIND11_MODULE(test, m) { m.def("add_arrays", &add_arrays, "Add two NumPy arrays");}
5. 参考资料
https://pybind11.readthedocs.io/en/stable/advanced/pycpp/numpy.html
2、https://github.com/tdegeus/pybind11_examples
3、https://blog.csdn.net/qq_28087491/article/details/128305877
4、https://www.cnblogs.com/JiangOil/p/11130670.html
5、https://zhuanlan.zhihu.com/p/383572973
6、https://zhuanlan.zhihu.com/p/192974017
来源地址:https://blog.csdn.net/i6101206007/article/details/131005851