今天小仙给大家分享一下Slope chart(坡度图)的画法,我在paper中看到的图是这样的
这个图的意思大概是Nasal Tissue比Brochial Tissue的ACE2表达量高(ACE2就是新冠病毒的受体啦) 。为了复刻这张图,小仙捏造了一组差不多的数据,竟然感觉比原图好看!
废话不多说,进入正题。
Step1. 绘图数据的准备
首先要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式,建议大家在excel中保存成csv格式。
作图数据格式如下:
Step2. 绘图数据的读取
data<-read.csv(“your file path”, header = T, check.names=F)
#注释:header=T表示数据中的第一行是列名,如果没有列名就用header=F
#注释:R读取数据的时候,默认会把列名里的空格变成 ".",check.names=F就不会变了
Step3. 绘图所需package的安装、调用
library(ggplot2)
library(reshape2)
# 注释:package使用之前需要调用
Step4. 绘图
data_melt<-melt(data,id.vars = "Sample")
# 注释:将原始的宽数据变成长数据,方便画图
p<-ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,group=Sample))+
geom_line(color="gray", size=1)+
geom_point(aes(fill=Sample),shape=21, size=3)+
theme_bw()+labs(x="",y="Relative expression")
p
直接画出来的图就是下面这样子的,线段和圆圈都是锯齿状的,对图片质量要求比较高、想让直线变平滑的朋友,可以参考我之前的分享《R语言作图技巧——导出高清图》。
如果把geom_point()语句跟geom_point()语句颠倒一下会发生什么呢?
p<-ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,group=Sample))+
geom_point(aes(fill=Sample),shape=21, size=3)+
geom_line(color="gray", size=1)+
theme_bw()+labs(x="",y="Relative expression")
p
语句颠倒,连线就会覆盖点的一部分,如果你想让哪个形状放在最上层,就把相应的画图语句放在后面就可以啦。
以上就是R语言数据可视化绘图Slope chart坡度图画法的详细内容,更多关于R语言数据可视化绘图坡度图的资料请关注编程网其它相关文章!