mongodb和CouchDB的区别有：1、mongodb比CouchDB速度快；2、CouchDB比mongodb安全一些；3、在mongodb中不可使用触发器，而在CouchDB中可以；4、mongodb将JSON数据序列化为BSON，而CouchDB不以JSON格式存储数据。
具体内容如下：
MongoDB和CouchDB都是文档数据库，两者很相似，数据存储格式都是JSON型的，都使用JavaScript进行操作，都支持Map/Reduce[9]。但其实二者有着很多本质的区别：
MVCC（Multiversion concurrency control）
MongoDB 与 CouchDB 的一大区别就是CouchDB 是一个MVCC的系统，而MongoDB是一个update-in-place 的系统。这二者的区别就是，MongoDB 进行写操作时都是即时完成写操作，写操作成功则数据就写成功了，而CouchDB 一个支持多版本控制的系统，此类系统通常支持多个结点写，而系统会检测到多个系统的写操作之间的冲突并以一定的算法规则予以解决。
水平扩展性
在扩展性方面，CouchDB 使用replication 去做，而MongoDB 的replication 仅仅用来增强数据的可靠性，MongoDB 在实现水平扩展性方面使用的是Sharding。（据说CouchDB 也有开发分片功能的计划）
数据查询操作
这个区别在用户接口上了，MongoDB 与传统的数据库系统类似，支持动态查询，即使在没有建立索引的行上，也能进行任意的查询。而 CouchDB 不同，CouchDB 不支持动态查询，你必须为你的每一个查询模式建立相应的view，并在此view的基础上进行查询。
原子性
这一点上两者比较一致，都支持针对行的原子性修改（concurrent modifications of single documents），但不支持更多的复杂事务操作。
数据可靠性
CouchDB 是一个”crash-only” 的系统，你可以在任何时候停掉CouchDB 并能保证数据的一致性。而MongoDB 在不正常的停掉后需要运行 repairDatabase() 命令来修复数据文件，在1.7.5 版本后支持单机可靠的 –dur命令。
Map/Reduce
MongoDB 和 CouchDB 都支持Map/Reduce ，不同的是MongoDB 只有在数据统计操作中会用到，而CouchDB 在变通查询时也是使用 Map/Reduce。
使用 javascript
MongoDB 和CouchDB 都支持javascript，CouchDb 用javascript来创建view。MongoDB 使用JSON作为普通数据库操作的表达式。当然你也可以在操作中包含javascript语句。MongoDB还支持服务端的javascript脚本（running arbitrary javascript functions server-side），当然，MongoDB 的Map/Reduce 函数也是javascript 格式的。
REST
CouchDB 是一个RESTFul 的数据库，其操作完全走HTTP协议，而MongoDB是走的自己的二进制协议。MongoDB Server在启动时可以开放一个HTTP 的接口供状态监控。
性能
此处主要列举了MongoDB 自己具有高性能的原因
采用二进制协议，而非CouchDB REST的HTTP 协议
使用Momary Map 内存映射的做法
collection-oriented，面向集合的存储，同一个collection的数据是连续存储的
update-in-place 直接修改，而非使用MVCC的机制
使用C＋＋ 编写
适用场景
如果你在构建一个 Lotus Notes 型的应用，我们推荐使用CouchDB，主要是由于它的MVCC机制。另外如果我们需要master-master 的架构，需要基于地理位置的数据分布，或者在数据结点可能不在线的情况下，我们推荐使用CouchDB。
如果你需要高性能的存储服务，那我们推荐 MongoDB，比如用于存储大型网站的用户个人信息，比如用于构建在其它存储层之上的Cache层。
如果你的需求中有大量 update 操作，那么使用MongoDB吧。就像我们在例子updating real time analytics counters 中的一样，对于那种经常变化的数据，比如浏览量，访问数之类的数据存储。
