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linux命令行下如何使用R语言绘图

2023-06-14 06:11

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小编给大家分享一下linux命令行下如何使用R语言绘图,希望大家阅读完这篇文章之后都有所收获,下面让我们一起去探讨吧!

使用系统:centos 6.4 64bit

在R语言中可以使用png()等函数生成图片,例如: png("aa.png")可以生成图片。

但是如果你是通过shell远程连接到系统上,可能会碰到如下错误:

> png("aa.png")

错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  : 

  无法打开PNG设备

此外: 警告信息:

In png("aa.png") : 无法打开链结到X11显示''

分析:

打开R控制台,输入capabilities(),可以看到:

> capabilities()  jpeg   png   tiff  tcltk   X11   aqua http/ftp sockets   FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE   TRUE   TRUE  libxml   fifo  cledit  iconv   NLS profmem  cairo   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE  FALSE  FALSE

可以看到png为false,因为生成图片需要X11,但是shell是没有X11的。

怎么解决:

在X11模式下执行R语言命令,也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图,那选择这个方式就可以了。

不使用X11生成,使用 图形渲染库Cairo。比如我,需要用脚本,根据实时数据生成统计图,那么用这个方式就很方便。

安装:

启动R控制台

安装

install.packages("Cairo")

会让你选择安装镜像

--- 在此連線階段时请选用CRAN的鏡子 ---CRAN mirror   1: 0-Cloud            2: Argentina (La Plata)     3: Argentina (Mendoza)      4: Australia (Canberra)     5: Australia (Melbourne)     6: Austria           7: Belgium            8: Brazil (BA)         9: Brazil (PR)         10: Brazil (RJ)        11: Brazil (SP 1)        12: Brazil (SP 2)       13: Canada (BC)         14: Canada (NS)        15: Canada (ON)         16: Canada (QC 1)       17: Canada (QC 2)        18: Chile           19: China (Beijing 1)      20: China (Beijing 2) 选一个北京的好了:20

安装出错

configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.

所以我们需要先在系统中安装cairo库

yum -y install cairo* libxt*安装完成之后,重新执行:install.packages("Cairo")installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs** R** preparing package for lazy loading** help*** installing help indices** building package indices** testing if installed package can be loaded* DONE (Cairo) 下载的程序包在‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages'里更新'.Library'里的HTML程序包列表Making 'packages.html' ... 做完了。

安装成功。

加载Cairo后,查看支持:

> library(Cairo)> Cairo.capabilities()  png  jpeg  tiff  pdf  svg   ps  x11  win raster  TRUE FALSE FALSE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE 说明已经支持用cairo生成图片了。例如可以使用如下命令生成PNG:CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

附上一个测试小程序,主要为了说明用法:

#vim test.rlibrary(Cairo)CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)plot(5,4)

保存后执行:

[root@localhost ~]# Rscript test.r  R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical ComputingPlatform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)> library(Cairo)> CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)> plot(5,4)>

在当前目录下可以看到生成了图片

[root@localhost ~]# ll总用量 84-rw-r--r--. 1 root root 6832 5月 13 10:33 out.png-rw-r--r--. 1 root root  71 5月 13 10:32 test.r

看完了这篇文章,相信你对“linux命令行下如何使用R语言绘图”有了一定的了解,如果想了解更多相关知识,欢迎关注编程网行业资讯频道,感谢各位的阅读!

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